- a -

• allocate4denvardata() : fourdenvardata
• allocate_data() : comms
• allocate_letks() : letks_data
• allocate_vardata() : var_data

- b -

• bin_prob() : random

- c -

• close_emp_o() : output_empire

- d -

• deallocate4denvardata() : fourdenvardata
• deallocate_data() : comms
• deallocate_letks() : letks_data
• deallocate_pf() : pf_control
• deallocate_traj() : traj_data
• deallocate_vardata() : var_data

- h -

• hqhtr_factor() : hqht_plus_r

- i -

• initialise_mpi() : comms
• initialise_mpi_v1() : comms
• initialise_mpi_v2() : comms
• initialise_mpi_v3() : comms
• initialise_mpi_v4() : comms
• initialise_mpi_v5() : comms
• irecv_all_models() : comms

- k -

• kill_histogram_data() : histogram_data
• kill_hqhtr() : hqht_plus_r
• killb() : bdata
• killq() : qdata
• killr() : rdata

- l -

• letks_filter_stage() : letks_data
• letks_increment() : letks_data
• lngamma() : random
• load_histogram_data() : histogram_data
• load_hqhtr() : hqht_plus_r
• loadb() : bdata
• loadq() : qdata
• loadr() : rdata

- m -

• matrix_pf_output() : matrix_pf

- o -

• open_emp_o() : output_empire

- p -

• parse_pf_parameters() : pf_control
• parse_vardata() : var_data

- r -

• random_beta() : random
• random_binomial1() : random
• random_binomial2() : random
• random_cauchy() : random
• random_chisq() : random
• random_exponential() : random
• random_gamma() : random
• random_gamma1() : random
• random_gamma2() : random
• random_inv_gauss() : random
• random_mvnorm() : random
• random_neg_binomial() : random
• random_normal() : random
• random_order() : random
• random_poisson() : random
• random_t() : random
• random_von_mises() : random
• random_weibull() : random
• read_background_term() : fourdenvardata
• read_ensemble_perturbation_matrix() : fourdenvardata
• read_lbfgsb_bounds() : var_data
• read_matrix_pf_information() : matrix_pf
• read_observation_numbers() : var_data
• recv_all_models() : comms
• rexp() : ziggurat
• rnor() : ziggurat

- s -

• seed_random_number() : random
• send_all_models() : comms
• set_pf_controls() : pf_control
• set_random_number_controls() : random_number_controls
• set_var_controls() : var_data
• setup_traj() : traj_data
• shr3() : ziggurat

- t -

• timestep_data_allocate_obs_times() : timestep_data
• timestep_data_deallocate_obs_times() : timestep_data
• timestep_data_get_obs_times() : timestep_data
• timestep_data_set_completed() : timestep_data
• timestep_data_set_current() : timestep_data
• timestep_data_set_do_analysis() : timestep_data
• timestep_data_set_do_no_analysis() : timestep_data
• timestep_data_set_is_analysis() : timestep_data
• timestep_data_set_next_ob_time() : timestep_data
• timestep_data_set_no_analysis() : timestep_data
• timestep_data_set_obs_times() : timestep_data
• timestep_data_set_tau() : timestep_data
• timestep_data_set_total() : timestep_data

- u -

• uni() : ziggurat

- v -

• verify_sizes() : comms

- z -

• zigset() : ziggurat